软件企业申请专利的过程可以分为以下几个步骤：

研发高质量的软件

首先，企业需要研发一个高质量的软件产品。这个软件不仅需要有创新性、实用性，还要有良好的应用场景，这样才能吸引专利审核人的注意，提高专利申请的通过率。

进行专利检索

在申请专利之前，企业需要进行全面的市场调研和专利检索，确认是否有同类型的产品或技术已经被申请或授权。这可以避免重复申请和潜在的侵权风险。

准备申请材料

根据申请类型（如发明专利、实用新型专利或外观设计专利），准备相应的申请材料。这包括填写著作权申请表、软件设计说明书、源代码、申请书（盖章）、营业执照副本（盖章）、承诺书（盖章）等。对于发明专利，还需要详细描述软件的技术方案，并以装置权利要求加方法权利要求的方式撰写权利要求书，以获得更为严密的保护。

提交专利申请

将准备好的申请材料提交给专利局。对于软件著作权，需要提交给版权局进行审核并付款，然后等待取证。对于软件产品登记，需要提交给当地的软件产品登记机构进行审核，审核通过后领取证书。

软件测试

在申请专利之前，企业可能需要对软件进行测试，以验证其功能和性能。测试结果可以作为申请过程中的重要参考资料。

寻求专业帮助

如果企业没有专利申请的经验，可以寻求专业的专利代理机构或专利代理人的帮助。他们可以提供专利检索服务、辅助撰写申请文件，并指导企业完成整个申请流程。

注意保护力度

由于软件专利的保护力度通常比软件著作权大，因此在申请过程中要特别注意保护力度，确保申请文件详细、清晰，并尽可能涵盖软件的全部创新点。

通过以上步骤，软件企业可以有效地申请专利，保护其技术创新成果。建议在申请过程中保持与专业机构的沟通，确保申请材料的准确性和完整性，以提高申请成功率。