《神奇宝贝》中火箭队的神奇宝贝们离开的主要情节如下：

阿伯怪和双蛋瓦斯

在 AG6《火箭队!疯狂乱抓再见了!》中，火箭队成员因与宝可梦猎人冲突被击飞，阿伯怪和双蛋瓦斯为救同伴含泪离开，小次郎在后续剧情中收复了沙漠奈亚。

果然翁

在 AG6《火箭队!疯狂乱抓再见了!》中，武藏因意外将大舌头交换为果然翁，但最终在交换大会上将其送回原主。

毒粉蝶

- 首次离队：

在 DP73《再见毒粉蝶》中，武藏的毒粉蝶因任务离开火箭队。

- 回归与进化：同集毒粉蝶进化为梅卡阳玛，但未再回归火箭队。

沙漠奈亚

- 首次离队：

在 DP3《再见!我的朋友尖牙笼》中，小次郎为救尖牙笼将沙漠奈亚送给草系道馆训练家。

- 回归与进化：在 DP54《菜子与沙漠兽，再见是为了谁》中，沙漠奈亚为救菜子离开，后进化为沙漠兽。

其他离别场景

- 大食花：

在 超世代AG262《奈奈与电击怪!》中，小次郎为保护电击怪放弃其进化形态大食花。

- 魔尼尼：在 AG147《魔尼尼登场!休息之馆》中，小次郎在交换会后得到魔尼尼。

补充说明：

部分离场景存在争议，例如果然翁的离队存在动画细节差异，但综合剧情可确认其最终回归。- 以上信息综合自动画剧集，未涉及剧场版或特别篇的离别情节。