遗传方差的计算通常涉及以下步骤：

确定数据：

首先，需要收集相关的数据，例如表型值（y1, y2, y3）和效应值（M, A, D）。

计算均值：

计算表型值的均值m，公式为：

$$

m = \frac{y1}{4} + \frac{y2}{2} + \frac{y3}{4}

$$

计算总遗传方差（Vg）：

根据已知的效应值，使用以下公式计算总遗传方差：

$$

Vg = \frac{y1^2}{4} + \frac{y2^2}{2} + \frac{y3^2}{4} - m^2

$$

其中，$y1, y2, y3$分别代表不同的表型值，M, A, D分别代表相应的效应值。

计算表型方差（Vp）：

表型方差Vp可以通过剩余方差Ve和遗传方差Vg相加得到。对于单QTL模型，公式为：

$$

Vp = Ve + Vg

$$

对于多QTL模型，则需要将各点的遗传方差相加：

$$

Vp = Ve + Vg1 + Vg2 + ... + Vgn

$$

计算遗传力（h^2）：

遗传力h^2是遗传方差Vg与表型方差Vp的比值：

$$

h^2 = \frac{Vg}{Vp}

$$

这些步骤可以帮助研究者了解基因型对表型变异的贡献程度，从而进行进一步的遗传分析。在实际应用中，这些计算通常通过统计软件完成，如R、Python等编程语言中的相关库函数。