软件行业开票流程如下：

登录税务系统

商家首先需要登录税务系统，选择“开具发票”功能。

输入客户信息

在开具发票时，需要输入客户的相关信息，包括名称、税号、地址电话等。

选择软件销售项目

选择具体的软件销售项目，并填写相关的发票内容，如软件名称、版本号、数量、单价和金额等。

选择合适的发票类型

根据软件销售的特点和客户需求，选择合适的发票类型。一般纳税人通常选择增值税普通发票，而需要抵扣增值税的企业客户则需要开具增值税专用发票。此外，还需要考虑客户是否需要电子发票或纸质发票。

规范填写发票内容

严格按照规定的内容和要求填写发票，确保所有信息的准确无误。这包括软件产品名称、数量、单价、金额、开具日期和发票号码等。

核对发票信息

在开具发票前，务必仔细核对所有信息，确保无误。

打印并交给客户

确认发票信息无误后，进行打印，并将发票交给客户。对于需要抵扣增值税的发票，还需要确保发票的合法性和有效性。

保存和归档发票

发票开具后，需要按照相关税务法规进行保存和归档，以确保发票的合法性和有效性。

遵循相关税务法规

在整个开票过程中，企业需遵循相关的税务法规，确保整个流程合法合规。这包括遵守税率和开票细节等可能根据国家政策有所调整的规定。

通过以上步骤，软件企业可以规范、高效地完成发票的开具工作，确保税务合规。