关于《神奇宝贝》中火箭队的最终结局，综合不同版本和剧情发展，主要存在以下两种说法：

一、动画正传结局

被小智击败

在动画正传的最终关头，火箭队在老宠回归后仍未能改变其反派本质。他们与小智展开最终对决，但最终被小智用“十万伏特”击败。

被收服

击败后，火箭队三人组（武藏、小次郎、小霞）被小智收服。武藏和小次郎选择与小霞共同生活，而小霞因姐姐的事情离开后，火箭队便正式解散。

二、动画特别篇补充说明

在《神奇宝贝大师9》的特别篇中，火箭队三人组因小智夺冠退休而面临下线危机。在剧情中，他们被派去送老宠，但最终因矛盾激化冲突，结局不欢而散。这一情节属于动画对原作角色背景的扩展设定，并非正传主线结局。

总结

若以原作主线剧情为准，火箭队最终被小智击败并收服；若考虑动画特别篇，则三人组因剧情发展而解散。不同版本存在差异，建议观众根据具体观看来源理解。