软件版权侵权的执法部门主要包括以下几类：

版权行政管理部门

国家版权局：负责全国范围内的著作权管理工作，可以通过其官网提交在线举报或拨打举报投诉电话12390进行举报。

地方版权局：各省、自治区、直辖市人民政府设立的版权行政管理部门，负责本地区的著作权管理工作。

公安机关

如果侵权行为涉嫌构成犯罪，如盗版、制售假冒伪劣产品等，可以向当地公安机关报案。

网络平台和互联网信息办公室

如果涉及网络侵权，可以向网络平台或互联网信息办公室举报。

行业协会

例如中国文字著作权协会等行业协会，可以提供维权支持和协助。

法院

如果侵权行为无法通过行政手段解决，可以通过法律途径向人民法院提起诉讼。

市场监督管理部门

负责对市场主体及其行为进行监督管理，包括侵权产品的查处。

中国版权保护中心

虽然不是执法部门，但作为国家版权局认定的唯一的软件登记机构，负责全国计算机软件著作权登记的具体工作，并提供相关的版权公共服务和社会服务。

综上所述，软件版权侵权的执法涉及多个部门，既有行政管理机构也有司法机关，还有行业协会和市场监督管理部门等。具体选择哪个部门进行举报或投诉，可以根据侵权行为的性质和具体情况来决定。