引物设计软件有多种，以下是一些常见的引物设计软件：

Primer 5 和 Primer 6：

这些是较早的引物设计软件，但仍在一些场合中被使用。

Beacon Designer：

由PREMIER生物软件公司研发，支持实时PCR引物和探针设计，包括分子信标和TaqMan探针。

Primer Express：

由Applied Biosystem研发，支持多种PCR引物设计，包括标准DNA PCR引物、RT-PCR引物等。

Perl Primer：

一个开源的GUI程序，可以与NCBI服务器结合进行引物BLAST。

Methprimer：

一个甲基化引物设计软件。

DNAman：

由美国LynnonBiosoft公司开发，是一款高度集成化的分子生物学应用软件。

Primer-Blast：

由NCBI开发，结合了Primer3和BLAST算法，用于引物特异性验证。

Oligo 6和 Oligo 7：

这两款软件功能强大，支持普通引物对搜索、测序引物设计、杂交探针设计等。

CEdesign：

专为DNA克隆相关专业人士设计的引物设计软件，支持多种克隆引物设计。

Primer Premier：

专业生物信息学软件，用于引物设计和PCR反应优化，支持多序列比对等功能。

这些软件各有特点，适用于不同的实验需求和用户水平。建议根据具体实验需求选择合适的引物设计软件。