自有软件的缴税方式需根据企业类型和软件性质综合判断，主要涉及增值税和企业所得税两大税种，具体如下：

一、增值税缴纳

一般纳税人

- 销售自行开发生产的软件产品，适用 13%的税率（部分早期政策文件可能显示17%）；

- 若实际税负超过3%，可申请即征即退，退税款可抵减研发成本。

小规模纳税人

- 销售计算机软件按 3%的征收率缴纳增值税；

- 商业企业销售软件按 4%的征收率（2025年现行政策）。

二、企业所得税缴纳

企业需按 25%的税率计算企业所得税（高新技术企业可享受15%优惠税率）；

软件企业的应纳税所得额为收入减除成本、费用、税金等后的余额。

三、其他注意事项

税务身份选择

- 个体户：适合小规模经营或个人开发者，需缴纳个税和增值税；

- 公司：适合规模较大或需享受高新技术企业优惠的企业。

税收优惠政策

- 高新技术企业：软件产品增值税可享30%的即征即退优惠；

- 科技创新项目：可能获得研发费用加计扣除。

申报与缴纳流程

- 定期提交财务报表和纳税申报表（一般纳税人每季度）；

- 通过电子税务平台（如自然人电子税务扣缴端）完成申报和缴费。

四、特殊情况处理

外购软件销售：

需按 13%的税率缴纳增值税，不享受即征即退政策；

专利或高新技术企业：软件销售收入可额外享受10%-30%的税率优惠。

建议根据企业规模、软件类型及税收政策，选择合适的税务身份，并通过专业税务顾问或软件辅助完成申报，以确保合规性。