软件退税的操作流程一般包含以下几个步骤：

确定退税资格

企业需要确保其软件开发和生产活动符合当地税务法规，并获得必要的认证和证书，例如《软件评测报告》、《软件产品登记证书》或《计算机软件著作权登记证书》。

准备必要文件

企业需要准备包括营业执照、合同、发票、软件评测报告等相关文件，以证明其退税资格和软件产品的合法性。

填写退税申请表

在电子税务局或通过税收减免计算机软件填写退税申请表，确保所有信息准确无误。

提交申请并跟进审核

将填写好的退税申请表及相关文件提交至税务机关，并跟进审核进度。税务机关会对提交的材料进行审核，以确定是否符合软件减免标准。

计算退税金额

税务机关会根据企业提交的完整减免资料和相关政策文件，计算应退税款金额。

准备结算凭证和开具减免税票据

在税务机关确认后，企业需要准备结算凭证，并依法开具减免税票据，以便实际获得退税。

缴纳剩余税款

根据税务机关的指示，在拍立出的税票上缴纳相应的税款。

建议

及时关注政策变化：软件退税政策可能会有所变动，企业应定期关注当地税务机关发布的最新政策，确保符合最新的退税要求。

保持沟通：在退税过程中，企业应与税务机关保持密切沟通，及时解决可能出现的问题，确保退税流程顺利进行。

使用自动化工具：考虑使用办公自动化系统或税收减免计算机软件，以提高退税申请的效率和准确性。

通过以上步骤，企业可以顺利完成软件退税的操作。