申请软件发明专利的流程大致可以分为以下几个步骤：

准备申请材料

发明专利请求书：包含发明名称、发明人姓名、申请人姓名和地址等基本信息。

说明书：详细描述软件的技术背景、发明内容、实施方式等，必要时附有附图。

说明书摘要：简要说明软件的技术要点。

权利要求书：明确专利保护范围。

提交申请

可以通过线上（专利电子申请系统）或线下（交到专利局受理窗口或寄交）方式提交申请文件。

受理和缴费

专利局收到申请文件后，会发出受理通知书及缴纳申请费通知书，申请人需按要求缴纳申请费。

初审

缴纳申请费后，专利申请进入初审阶段。

公布

初审通过后，专利申请会被公布。

实质审查

实质审查是专利授权的关键阶段，审查员会对申请文件进行全面审查，确保其符合专利法要求。

授权

通过实质审查后，专利局会发出授权通知书，表明同意授权。

在准备申请材料时，应注意以下几点：

申请文件应打印清晰，无涂改痕迹。

附图和图片需用绘图工具和黑色墨水复制，照片需清晰无修改。

申请人、申请名称、申请专利类别等资料需填写完整。

此外，在申请前，建议进行专利检索，以确保发明的新颖性和创造性，避免与现有技术重复。可以通过专利数据库、非专利数据库等进行检索，分析其他相关方案的缺陷，以体现发明方案的意义。

最后，建议在申请过程中咨询专业的专利代理人或律师，以确保申请文件的质量和申请流程的顺利进行。